Otopsi genellikle ailenin isteği üzerine yazılı izin vermesi nedeniyle yapılır. Adli vakalarda ise savcının isteği üzerine otopsi yapılır ve aileden izin alınması gerekmemektedir. Genellikle Cumhuriyet Savcısı tarafından şüpheli ölüm neticesinde öncelikle ölü muayene işlemi yapılır. Ölü muayene işlemi adli tabip refakatinde gerçekleşir ve sadece ölünün dış muayenesidir. Eğer Adli Tabip ölüm muayene işlemi sonucunda kesin ölüm sebebini bildirimez ise, Cumhuriyet Savcısı ölümün kesin sebebi için adli tıp kurumuna sistematik otopsi yapılması için gönderir.